跨省施工企业开票需要遵循以下步骤：

了解当地税务规定

在跨省施工前，企业应了解工程所在地的税务规定，包括税率、发票种类、纳税方式等，以确保能按照当地要求进行税务处理。

办理外出经营许可证

在公司所在地的税务局开具《外出经营管理证明》（俗称“外管证”或“外经证”）。

预缴税款

携带相关合同和发票原件及复印件，到施工项目所在地的主管税务机关预缴税款。填写《增值税预缴税款表》，并缴纳应预缴的增值税额。税务机关会开具税收完税证明。

开具发票

回到机构所在地，通过电子税务局开具增值税发票，并确保发票信息准确无误。注意发票备注栏需填写项目所在的地市县及项目名称。

电子化申报与缴税

根据当地税务部门的要求，进行电子化申报与缴税。通过税务系统上传申报数据，并按照规定期限缴纳税款。

保存相关资料

施工企业应妥善保存发票、申报表等涉税资料，以备后续核查。

核销外经证

项目结束后，持相关资料到机构所在地税务机关核销外经证。

建议

及时沟通：与工程所在地的税务部门保持密切沟通，确保了解最新的税务政策和要求。

专业咨询：如有必要，可咨询专业的税务顾问或会计师，以确保税务处理的准确性和合规性。

资料备份：确保所有涉税资料的完整和备份，以防丢失或损坏。