会计档案的编号方法如下：

全宗号

全宗号一般由政府档案局规定，政府所属单位的全宗号从档案局查询。企业，尤其是民营企业，由单位自定。如果单位规模不大，可以不用全宗号。

目录号

目录号是指案卷在全宗中的编号，即这本档案在第几本目录上可以查到。目录号应填写全宗内案卷所属目录的编号，在同一个全宗内不允许出现重复的案卷目录号。企业或参照《工业企业档案分类试行规则》编制分类方案的单位，可填写类别特征代码。

案卷号

案卷号是指目录内案卷的顺序编号，在同一个案卷目录（或分类体系的最低一级类目）内不允许出现重复的案卷号。案卷号可以采用大流水号或小流水号的方式进行编号。

大流水号：即凭证、账簿、财务报告分别编各年度累计的大流水号。例如，2002年有12本凭证编1-12号；

2003年从13号开始编号。

小流水号：即同一年度同一类型的会计档案案卷都从1开始编卷号。例如，2002年有12本凭证，编1-12号，2003年又从1号开始编号。

类别编码

会计档案一般分为：会计凭证、会计账簿、财务报告、其他四类。加上年度因素，目录编号格式如下： 大类编码+小类编码+年度+上当顺序号。

例如：

会计凭证：J1. 收款凭证J1.1，付款凭证J1.2，转帐凭证J1.3，如果还有其它类别，依此类推。

会计账簿：J2. 帐簿一般按年度进行分类，可以依上述方法进行编号。