挂靠管理费的处理通常遵循以下步骤和原则：

合同无效性

如果挂靠合同被认定为无效，根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》（简称“建工司解”）第四条，被挂靠方通常无权要求挂靠方支付管理费。

非法所得的处理

挂靠管理费可能被视为非法所得，根据民法通则第一百三十四条，人民法院有权收缴当事人已经取得的非法所得。

法院处理方式

在法院审判实务中，大多数情况下，法院不会采用收缴方式处理挂靠管理费，而是可能向相关行政机关提出司法建议，由行政机关进行处罚。

账务处理

建筑企业支付给挂靠公司的管理费应计入管理费用科目。

如果被挂靠方收取了管理费，可能记入“其他业务收入”科目。

会计分录示例

支付管理费给挂靠公司时：

借：管理费用-服务费

贷：银行存款

收到管理费时：

借：银行存款或应收账款

贷：其他业务收入

```

税务处理

涉及增值税时，需根据税率计算并缴纳相应的增值税。

最高人民法院的观点

最高人民法院第二巡回法庭提出了三种关于管理费处理的观点，包括参照合同约定说，即如果工程竣工验收合格，即使合同无效，工程价款也应按合同约定支付，管理费作为价款的一部分也应参照约定处理。

请注意，具体情况可能因案件细节和当地法律实践而异，建议在实际操作中咨询专业律师或会计师