分公司开始做账时，应遵循以下步骤和原则：

设立独立账户

分公司应开设一个独立的银行账户，以便于独立记录和管理收入与支出。

合同签署

若合同以分公司名义签署，所有财务活动应通过分公司账户结算。

若合同以总公司名义签署，分公司需提供成本票据，由总公司进行账务核算和税务申报。

税务合规与纳税

分公司需遵循当地税务政策，合法纳税，并保持良好的财务记录。

分公司应按时完成纳税申报，避免逾期带来的罚款和利息。

款项转账流程

完成财务记录和成本票据提供后，通过银行账户进行款项转账。

会计科目设置

总公司与分公司可以是独立核算的，双方独自核算。

若不是独立核算，需设置企业所得税税种，按法人企业申报缴纳企业所得税。

账务处理方式

报账制：分公司不设会计，由出纳记录现金和银行存款流水账，并将发票等原始凭证送总公司核算。

分账制：分公司设会计和出纳，对业务活动进行核算，并将会计报表送总公司合并报送。

报表合并

总公司与分公司报表合并时，内部往来账目应相互抵消，不影响全公司对外披露的会计信息真实性。

财务管理软件

使用财务软件时，可将科目设置为部门核算，以全面反映分公司财务状况。

遵守法规

分公司应遵守会计核算规定，使用传统或电子账务系统处理财务记录，确保财务信息的准确性和完整性。

请根据分公司的具体情况选择合适的核算方式，并确保所有操作符合当地法律法规和税务政策。