昆明医科大学是云南省内提供临床医学专业教育的主要院校之一。该校是云南省最大的集教学、医疗、科研为一体的高等医学院校，并且是国家“中西部高校基础能力建设工程”重点建设高校和云南一流学科建设高校。昆明医科大学设有多个与临床医学相关的学院和系部，包括基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、法医学院、药学院、护理学院、人文学院、高等职业教育学院、临床肿瘤学院、国际教育学院以及第一、第二临床医学院等，提供包括临床医学在内的多种医学专业教育。
此外，昆明医科大学继续教育学院也提供成人学历教育，涵盖临床医学等专业。云南医药健康职业学院、昆明卫生职业学院和云南医学高等专科学校也是昆明地区提供临床医学专业教育的院校。
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