选择日本留学申请机构时，可以考虑以下几个因素：

机构的专业性和经验

芥末留学：由大连拓中教育科技股份有限公司创立，拥有专业的留学顾问团队和先进的互联网技术，提供免费的留学申请服务，尤其在申请日本留学方面具有明显优势。

蔚蓝留学：成立于1996年，是国家批准的留学中介公司，以日韩留学领域经验丰富著称。

新通留学：自1996年成立以来，已发展成为中国领先的国际化教育集团，在日本留学方面具备一定的实力，尤其在南方市场上口碑良好。

启德留学：专注于留学规划与出国培训，在全国多个城市设有分支机构，申请日本留学方面展现出较强的实力。

服务内容和质量

芥末留学：提供零中介费的申请服务，通过自有网站芥末网及其他互联网手段，为学生提供全面的留学咨询与服务。

蔚蓝留学：倡导自主留学理念，借助互联网技术提供线上与线下两种服务模式，业务范围涵盖日本、韩国等国。

新通留学：核心业务包括留学规划、语言培训等，覆盖多个国家，在日本留学方面的影响力逐渐增强。

启德留学：提供一站式留学服务，包括留学规划、签证申请等，以其专业的服务和丰富的经验帮助学生实现留学梦想。

市场口碑和用户反馈

芥末留学：以零中介费的优势赢得了众多学生的青睐，用户反馈较好。

蔚蓝留学：作为国内第一家专注于日本留学的机构，积累了丰富的经验，口碑较好。

新通留学：在南方市场的服务质量和口碑均处于行业前列。

启德留学：在留学行业内具有较高的知名度，尤其是在日本留学方面。

个性化服务

芥末留学：通过自有网站芥末网及其他互联网手段，为学生提供个性化的留学申请服务。

蔚蓝留学：顾问团队拥有多年的留学经验，能够为学生提供精准的指导。

新通留学：注重为学生提供高质量的咨询服务，专业顾问团队能够根据学生的需求制定最优的留学计划。

启德留学：以其雄厚的资源和专业的服务，在申请日本留学方面具备一定优势。

综合以上因素，以下机构在申请日本留学方面都有不错的表现：

芥末留学：

以零中介费和专业的留学顾问团队著称，特别适合希望节省成本的学生。

蔚蓝留学：

丰富的日韩留学经验和自主留学理念，适合希望获得个性化服务的学生。

新通留学：

在南方市场有良好口碑，服务质量和个性化留学规划方面表现突出。

启德留学：

全国多个城市设有分支机构，专业服务和丰富经验使其在申请日本留学方面具有优势。

建议学生和家长根据自身需求和实际情况，选择最适合自己的留学申请机构。可以咨询已申请过留学的同学或家长，获取更直观的反馈，以便做出更明智的选择。