根据搜索结果，地理信息系统（GIS）研究生报考学校的选择需结合学科实力、专业方向及个人兴趣。以下是综合多个来源的推荐及分析：

一、顶尖综合类高校

北京大学

在遥感科学与技术、地理信息系统等领域实力领先，拥有北师大遥感国家重点实验室（中科院遥感所共建）。

优势方向：遥感、自然地理与资源环境。

武汉大学

测绘科学与技术为国家级重点学科，拥有资环院、遥感院、国重室三大科研平台，全亚洲遥感领域排名第一。

优势方向：遥感、地理信息工程、大地测量。

南京师范大学

遥感科学国家重点实验室所在地，师范类院校地理学科优势显著，保送比例高达60%。

优势方向：遥感、地理信息科学教育与研究。

二、特色鲜明专业强校

中国地质大学（武汉）

地质资源与地质工程领域突出，与国家地质调查局等机构合作紧密，适合关注资源调查与工程应用方向的学生。

华东师范大学

地图学与地理信息系统学科实力强劲，前身为浙江大学地理系，全国学科排名第三。

优势方向：基础地理学、遥感技术、地理信息系统。

北京师范大学

以遥感科学见长，拥有长江学者、院士等顶尖科研团队，科研项目覆盖广泛。

优势方向：遥感理论、环境变化监测。

三、其他推荐院校

同济大学 （B类）：工程类与地理信息结合紧密，城市规划、遥感技术实力突出。

中国海洋大学 （B类）：海洋地理信息系统方向有特色，适合关注海洋资源管理的学生。

中南大学 ：测绘科学与技术为省级重点学科，工业应用方向较强。

四、选择建议

明确方向 ：优先考虑遥感、工程应用或教育研究方向，对应北师大、武大、南师；若关注资源调查则选中国地质大学。

关注招生信息 ：部分院校（如北师大）保送比例较高，需结合自身竞争力选择。

综合评估 ：结合学校排名、实验室资源及就业前景，建议参考最新考研动态（如复试拟排名）。

以上推荐综合了学科实力、实验室资源及就业竞争力，具体选择需结合个人兴趣和职业规划。