事业单位工程设计费，计入在建工程科目核算，资产增加计入借方核算。同时会导致货币资金减少，资产减少计入贷方核算。事业单位工程设计费的账务处理是，
借：在建工程，
贷：银行存款等科目。
完工的时候结转到固定资产核算。
企业单位和事业单位的区别：
企业单位是以盈利为目的独立核算的法人或非法人单位。事业单位是指由政府利用国有资产设立的，从事教育、科技、文化、卫生等活动的社会服务组织，是带有公益性质的机构。
企业单位的特点是自收自支，通过成本核算，进行盈亏配比，通过自身的盈利解决自身的人员供养，社会服务，创造财富价值。
事业单位接受政府领导，是表现形式为组织或机构的法人实体。事业单位的明显特征为中心、会、所、站、队、院等字词，分为参公事业单位以及一般事业单位。受国家行政机关领导，没有生产收入、所需经费由公共财政支出、不实行经济核算、主要提供教育、科技、文化、卫生等活动非物质生产和劳务服务的社会公共组织，事业单位接受政府领导，是表现形式为组织或机构的法人实体。
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