工资个人所得税的计算遵循以下步骤：

确定起征点

起征点为每月5000元，即月收入超过5000元的部分才需纳税。

计算应纳税所得额

应纳税所得额 = 月收入 - 五险一金 - 起征点 - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 其他依法确定的扣除。

应用税率和速算扣除数

根据应纳税所得额，查找对应的税率和速算扣除数。

个税采用超额累进税率，税率从3%至45%不等。

速算扣除数是为了简化计算而设定，在计算应纳税额时可以直接扣除。

计算应纳税额

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。

实际发放工资

实发工资 = 应发工资 - 五险一金 - 应纳个人所得税。

例如，如果某员工月工资为29000元，扣除五险一金3000元后，收入为26000元。扣除起征点5000元后，应纳税所得额为21000元。根据税率表，21000元属于“超过15000元至25000元的部分”，适用税率为20%，速算扣除数为1692元。因此，该员工应缴纳的个税为：

```

应纳税额 = 21000元 × 20% - 1692元 = 4200元 - 1692元 = 2508元

```

所以，该员工实际到手的工资为：

```

实发工资 = 29000元 - 3000元 - 2508元 = 23492元

```

以上步骤和计算方式可以帮助您了解工资个人所得税是如何扣除的。