增值税专用发票作废有两种方式，具体如下：

1、可以通过对增值税专用发票的全部联次注明作废字样或加盖作废戳记来进行作废；

2、可以通过开具红字专用发票来进行作废。如果需要作废的增值税专用发票，在作废了之后，务必要把作废的发票留存以备下次购买发票税务验旧时备查。

增值税专用发票由基本联次或者基本联次附加其他联次构成，基本联次为三联：

1、第一联：记账联，是销货方发票联，是销货方的记账凭证，即是销货方作为销售货物的原始凭证，在票面上的“税额”指的是“销项税额”，“金额”指的是销售货物的“不含税金额价格”发票三联是具有复写功能的，一次开具，三联的内容一致第一联是记账联（销货方用来记账）；

2、第二联是抵扣联（购货方用来扣税）；

3、第三联是发票联（购货方用来记账）；

综上所述，增值税专用发票是由国家税务总局监制设计印制的，只限于增值税一般纳税人领购使用的，既作为纳税人反映经济活动中的重要会计凭证又是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明；是增值税计算和管理中重要的决定性的合法的专用发票。

【法律依据】：

《增值税专用发票使用规定》第二十条

同时具有下列情形的，为本规定所称作废条件：

（一）收到退回的发票联、抵扣联时间未超过销售方开票当月；

（二）销售方未抄税并且未记账；

（三）购买方未认证或者认证结果为“纳税人识别号认证不符”、“专用发票代码、号码认证不符”。

本规定所称抄税，是报税前用IC卡或者IC卡和软盘抄取开票数据电文。