自然人持股意思就是由自然人来持有股票的。自然人股东是相对于法人股东而言的，指的是具有公民身份的个人投资者，在给公司投资之后通过公司所在地的工商局的注册，然后进行公司股权的登记以后，就会成为自然人股东了。自然人是基于自然出生的并且依法在民事上享有权利以及承担义务的个人。股东是股份制企业的出资人或者叫投资人继通过有限责任公司以及合伙企业间接持股之后，基金专户子公司股权激励后首次出现了自然人持股，股权激励持股的三种方式也一一浮出了水面。

自然人股东和法人股东的区别

指代的不同：自然人股东指的是具有公民身份的个人投资者，在进行公司的投资以后通过公司所在地的工商局的注册，在进行公司股权登记以后，就会成为自然人股东了。法人股东也称为单位股东，指的是以公司或者集团(机构)的名义来占有其他企业股份的股东。

利弊的不同：自然人股东是一个具体的人，个人享有并且可以直接行使股东权利并且需要承担义务，比如参加股东会，查阅财务会计的资料以及领取股红等。法人股东是作为抽象的依法拟制的实体存在的，它的权利和义务的行使和承担，是需要通过具体人的行为来完成的，方式是派出股东代表，凭借授权委托的手续代表其完成，后果都是由组织承担的。

主体资格不同：自然人股东是在股权交易各方在签订股权转让协议并且完成股权转让交易以后至企业变更股权登记之前，担负有纳税义务或者代扣代缴义务的转让方或者受让方，是应该到主管税务机关办理纳税（扣缴）申报的。对于法人股东来讲企业法人对公司出资成为公司股东的前提是要具有民事权利的能力。该企业法人必须依法存续，也就是企业法人应该具有《民法通则》规定的条件，没有依法办理核准登记手续的，是不存在被撤销、解散、宣告破产或者其它终止企业法人的情况的。