分公司申报所得税的流程如下：

开立扣税账户

首先，需要去银行开立一个扣税账户，以便于后续的税款扣除和缴纳。

税务登记

分公司需要办理税务登记证，并在领取营业执照后三十日内完成这一手续。

申报纳税

营业税：在劳务发生地缴纳。

企业所得税：由总机构汇总申报。如果分公司符合独立核算的条件，应单独申报缴纳企业所得税，适用经营所在地的企业所得税税率。

代扣缴个人所得税：由支付工资的机构代扣缴。

汇算清缴

纳税人在纳税年度内预缴的企业所得税税款少于应缴税款时，应在汇算清缴期内结清应补缴的税款。预缴税款超过应纳税款的，主管税务机关应及时办理退税或抵缴下一年度应缴税款。

网上申报

随着国税和地税合并，分公司可以通过网上申报的形式来缴纳税费。如果分公司没有使用过网上税务申报功能，需要携带营业执照、开户行等资料去当地税务部门申请开通网上申报税务服务。

零申报

如果分公司不涉及独立纳税人且没有经营收入，可以申报为0，并按月份或季度进行申报和提前缴纳。

汇总纳税备案

分公司通常需要与总公司汇总缴纳企业所得税。在税务登记时，会核定企业所得税种，并进行汇总纳税备案。新成立的分公司在第一年不需要申报企业所得税，但需要报送财务报表。

年度纳税申报表

分公司在进行年度企业所得税申报时，需要报送企业所得税年度纳税申报表、汇总纳税企业分支机构所得税分配表、年度财务报表以及参与企业年度纳税调整情况的说明。

建议：

分公司应确保及时完成税务登记和网上申报，以便按时缴纳所得税。

如果分公司符合独立核算条件，应单独申报企业所得税，并在汇算清缴期内结清应补缴的税款。

分公司应与总机构和税务部门保持沟通，确保税务申报的准确性和及时性。