税务局季度扣税的方式如下：

电子税务局平台扣款

企业可以通过电子税务局平台，签订第三方协议后直接进行扣款。适用于增值税、附加税、印花税和企业所得税等税种。在申报成功后，企业可以选择预约扣款，并自行选择扣款日期。

税务局大厅缴纳税款

企业也可以亲自到税务局大厅进行缴纳税款。适用于所有税种，包括房产税和城镇土地使用税，这些税种在申报成功后会自动扣款。

企业所得税预缴

企业每个季度需要根据上一季度的实际生产经营情况，预缴本季度的企业所得税。预缴金额通常是根据上一季度应纳税所得额的一定比例确定的。

个人所得税计算

季度奖金的个人所得税计算方式有两种：

如果发放奖金的当月工资高于5000元，奖金会先扣除个人所得税，计算公式为：奖金 × 税率 - 速算扣除数。税率是按奖金除以3（一个季度时间）作为“应纳税所得额”对应的税率。

如果员工当月工资薪金不超过5000元，再发放的奖金会单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。此外，一次性奖金可以减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，作为应纳税所得额。

年度汇算清缴

企业需要在年度终了后5个月内，进行年度汇算清缴，计算全年应纳税所得额，并根据规定补缴或退还税款。具体操作步骤包括填写纳税申报表，向税务机关报送，并按时缴纳税款。企业可以通过网上税务局、办税服务厅等途径完成申报和缴税。