年底在建工程的账务处理主要包括以下几个步骤：

核算在建工程成本

领用工程物资、原材料或库存商品时：

借：在建工程

贷：工程物资/原材料/库存商品

支付工程人员工资及福利时：

借：在建工程

贷：应付职工薪酬

支付发生的其他工程费用时（包括增值税）：

借：在建工程

应交税费—应交增值税（进项税额）

贷：银行存款

结转在建工程

当在建工程完工并满足预定可使用状态时，根据审核过的工程决算书和发票进行结转：

借：固定资产

贷：在建工程

结转分录示例（以固定资产预算决算价和白条及未付款为例）：

借：固定资产 （决算价）

贷：在建工程 （账面实际金额）

贷：应付账款 （白条和未付款金额）

处理相关税费

在建工程发生的管理费、征地费、可行性研究费、临时设施费、公证费、监理费及应负担的税费等，按合理估计的发包工程进度和合同规定结算的进度款进行核算：

借：在建工程

贷：银行存款/应付利息等

处理增值税

涉及增值税的支出，需要进行相应的处理。

处理退库手续

在建工程完工已领出的剩余物资应办理退库手续：

借：工程物资

贷：在建工程

其他注意事项

在建工程科目可按“建筑工程”、“安装工程”、“在安装设备”以及单项工程等进行明细核算。

如果在建工程成本无法准确计量，可暂估入账，并根据实际结算成本调整暂估成本。

以上步骤和会计分录是基于最新的参考信息整理而成，具体操作时还需结合实际情况和当地税务部门的规定。