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PEP是什么，求快速回复，真的等不了了！
答精选答案
.fa是基因组/某条或者某几条染色体/scanffold/contig的fasta格式序列，这里估计是组装后的基因组吧.gff3是注释文件.cds是这注释信息里的蛋白编码序列，一般会是gff3文件里基因的最长转录本.pep就是.cds里对应序列翻译成的氨基酸序列
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本文概览：.fa是基因组/某条或者某几条染色体/scanffold/contig的fasta格式序列，这里估计是组装后的基因组吧.gff3是注释文件.cds是这注释信息里的蛋白编码序列，一般会是gff3文件里基因的最长转录本.pep就是.cds里对应序列翻译成的氨基酸序列