南京的二本民办大学中，以下几所被广泛认为优秀：

南京审计大学：

该校的审计专业在民办大学中独树一帜，毕业生就业率一直保持高位。

南京信息工程大学：

虽然为民办，但在信息技术领域享有很高的声誉，尤其是其国家级示范性软件学院。

南京理工大学紫金学院：

由南京理工大学和香港上市公司紫金矿业集团合作创办，拥有优秀的教师队伍和先进的教学设施，专业包括计算机科学与技术、土木工程等。

南京航空航天大学金城学院：

作为南京航空航天大学的附属本科院校，注重航空航天领域的教育和研究，拥有一流的师资力量和现代化的教学设施。

南京传媒学院：

位于江苏省南京市，是江苏省唯一一所以传媒类型为主的本科院校，全国排名第11名，艺术类民办大学排名第1名，江苏省民办大学排名第2名。

南京审计大学金审学院：

由南京审计大学与江苏金圆集团合作创办，注重培养学生的实践能力和创新能力，专业包括金融学、会计学、国际经济与贸易等。

建议

南京审计大学和 南京信息工程大学在专业领域内具有明显优势，尤其是审计和信息科技方面。

南京理工大学紫金学院和 南京航空航天大学金城学院则凭借其合作办学的背景和先进的教学设施，成为较多学生的选择。

南京传媒学院在传媒领域有较高的声誉，适合对传媒专业感兴趣的学生。

南京审计大学金审学院则注重实践和创新能力培养，适合希望提升实际操作能力的学生。

根据以上信息，你可以根据自己的兴趣和专业方向，选择最适合自己的院校。