哈尔滨工业大学通常被认为是哈尔滨最牛的大学。它是中国顶尖的工科学府，尤其在航空航天和材料科学领域享有盛誉。哈工大始建于1920年，现拥有哈尔滨、威海、深圳三个校区，是一所以理工为主，理、工、管、文、经、法、艺等多学科协调发展的国家重点大学，也是国家“211工程”重点建设高校。

哈工大在工程类大学中通常位居前列，并且是中国首批进入“双一流”建设高校之一。此外，哈工大在第四轮学科评估上共有17个A类专业，显示出其在多个学科领域的强大实力。

哈尔滨工程大学也是一所非常不错的工科学校，以船舶工程、海洋工程和军事航天技术著名。它同样是985、211工程的重点大学，并且是国家首批“双一流”世界一流学科建设高校。

东北林业大学和东北农业大学也是哈尔滨知名的高校，分别专注于林业科学和工程教育，以及农科和生命科学教育。这两所大学在各自的领域内都有显著成就，并且都是国家“211工程”重点建设高校。

哈尔滨医科大学在医学领域表现良好，常进入全国一流大学的医学专业排名。它有两个校区，总面积3540亩，是国家教育部首批试办七年制高等医学教育的院校。

黑龙江大学、哈尔滨师范大学、哈尔滨理工大学、黑龙江中医药大学和哈尔滨商业大学等也是哈尔滨的重要高校，各有其特色和优势。

综合考虑各大学的学科实力、历史声誉、教育资源和社会影响力，哈尔滨工业大学在哈尔滨乃至全国范围内都是最顶尖的大学之一。如果以工程科学和航空航天领域为主要考量因素，哈工大无疑是首选。对于其他学科领域，哈尔滨工程大学和东北林业大学也是非常好的选择。