自动化专业的二级学科选择主要取决于个人的兴趣、职业规划以及未来的发展方向。以下是一些建议的二级学科及其特点：

控制理论与控制工程

这是自动化专业中最基础的学科，主要研究系统的动态行为、稳定性、可控性和最优控制策略。

该学科在工程实践中应用广泛，如工业过程控制、机器人控制等。

清华大学、哈尔滨工业大学、浙江大学等高校在该领域具有很高的学术声誉。

模式识别与智能系统

该学科专注于智能系统的设计、实现和应用，包括机器学习、计算机视觉、人工智能等。

模式识别与智能系统在近年来发展迅速，应用领域广泛，如人脸识别、自动驾驶等。

清华大学、上海交通大学、东南大学等高校在该领域有很强的研究实力。

检测技术与自动化装置

该学科主要研究传感技术、信号处理、自动化仪表与装置的设计和应用。

检测技术与自动化装置在工业自动化、医疗设备等领域有广泛应用。

清华大学、浙江大学、华中科技大学等高校在该领域有较好的研究基础。

系统工程

系统工程主要研究复杂系统的建模、分析、设计和优化方法。

该学科在智能交通、智能物流、能源管理等系统有广泛应用。

清华大学、西安交通大学、华中科技大学等高校在该领域有显著的研究成果。

导航、制导与控制

该学科主要研究导航系统的设计、制导与控制算法，应用于航空航天、导弹等领域。

北京航空航天大学、哈尔滨工业大学、哈尔滨工程大学在该领域具有很高的学术地位。

建议

兴趣优先：选择自己最感兴趣的学科方向，这样在学习过程中更容易保持热情和动力。

职业规划：考虑自己的职业目标，选择与之相关的学科方向，有利于未来的就业和发展。

学术实力：了解各知名高校在该学科的研究实力和就业情况，选择学术实力较强的高校有助于提升自己的学术水平和竞争力。

综合考虑以上因素，自动化专业的二级学科中， 控制理论与控制工程、 模式识别与智能系统、 检测技术与自动化装置、 系统工程和 导航、制导与控制都是非常有前景的选择。具体选择哪个方向，还需根据个人的兴趣和职业规划做出决定。