吉林大学作为一所历史悠久的985高校，在历史上曾经有过辉煌的时期，但近年来面临了一些挑战，导致其声誉和影响力有所下滑。以下是吉林大学面临的一些主要问题：

地域因素

吉林大学位于东北的吉林省长春市，近年来东北地区的经济呈现下降趋势，影响了当地的教育资源投入，进而影响了吉林大学的发展。

东北地区的地理位置相对偏僻，冬季寒冷且时间长，这些自然条件使得一些南方学生不愿意选择吉林大学。

经济因素

随着中国经济中心的南移，东北地区失去了资源优势，经济发展相对滞后，这对吉林大学吸引优秀师资和学生产生了不利影响。

合并问题

吉林大学在历史上经历了多次合并，形成了庞大的校区和学科门类，虽然在校生规模庞大，但学科实力分布不均，影响了学校的整体声誉。

学科评估结果

尽管吉林大学在学科评估中取得了一定的成绩，拥有多个A类学科，但与公众的高预期相比，仍存在一定的差距。

社会认知

互联网时代信息传播迅速，一些关于吉林大学的负面信息在网络上流传，放大了其声誉问题。

招生和就业

吉林大学的录取分数相对较低，一些专业实力不足，影响了其在招生市场的竞争力。

就业方面，由于地域和行业发展限制，吉林大学的学生在就业市场上可能面临一定的挑战。

综上所述，吉林大学面临的挑战是多方面的，包括地域、经济、合并问题、学科评估结果、社会认知以及招生和就业等方面。这些问题相互交织，共同影响了吉林大学的发展和声誉。