军队院校的投档流程通常遵循以下步骤和原则：

投档比例

军队院校招生通常分为本科提前批A、B两个批次。

一志愿发档比例通常为学校招生计划的110%。

二志愿发档比例通常为学校招生计划的100%。

投档顺序

对于实行顺序志愿投档的省份，考生按照招生计划数量的110%投档，总分成绩相同的情况下，依次比较单科成绩，文科专业比较顺序为语文、数学、外语，理科专业比较顺序为数学、语文、外语。

对于实行平行志愿投档的省份，考生按照招生计划数量的100%投档。

特殊群体优先

烈士子女、因公牺牲军人的子女、现役军人子女在投档比例范围内有优先录取的权利。

投档程序

省级高校招生办公室首先从政治考核、面试和体检合格的考生中，区分性别，按军队院校招生专业计划数的120%投档。

军队院校招生办公室再根据专业计划数从高分到低分依次确定录取对象，分数相同的情况下优先录取专业学科成绩好的考生。

缺额计划

如果一志愿生源不足，省教育考试院会公布缺额计划，并组织二志愿征集，按二志愿发档、录取。

对于指挥专业，如果线上生源仍不足，经招生院校同意后，可在本科二批录取控制线上，按照计划缺额的100%，将二志愿考生从高分到低分依次投档。

其他注意事项

军校生和国防生属于提前批，考生需要关注相关招生指南，并在高考成绩达到投档分数线后填报志愿。

考生还需要通过政审和体检，未被录取的考生可以按其填报的地方高等院校录取。

以上信息基于您提供的参考信息和我所知的相关流程，具体细节可能会因省份和年份有所不同，请以当地教育考试院的最新公告为准。