原子（atom）指化学反应的基本微粒，原子在化学反应中不可分割。原子直径的数量级大约是10^-10m。原子质量极小，且99.9%集中在原子核。原子核外分布着电子电子跃迁产生光谱，电子决定了一个元素的化学性质，并且对原子的磁性有着很大的影响。所有质子数相同的原子组成元素，每一种元素至少有一种不稳定的同位素，可以进行放射性衰变。
分子（Molecule）是独立存在而保持物质化学性质的一种粒子。分子有一定的大小和质量；分子间有一定的间隔；分子总是在不停地运动；分子间有一定的作用力；分子可以构成物质；分子在化学变化中还可以被分成更小的微粒：原子；分子可以随着温度的变化而改变间隔大小。同种分子性质相同，不同种分子性质不同。大的分子其相对分子质量可高达几百万以上。相对分子质量在数千以上的分子叫做高分子。
电子是构成原子的基本粒子之一，质量极小，带负电，在原子中围绕原子核旋转。不同的原子拥有的电子数目不同，例如，每一个碳原子中含有6个电子，每一个氧原子中含有8个电子。能量高的离核较远，能量低的离核较近。通常把电子在离核远近不同的区域内运动称为电子的分层排布。
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