查询医师资格证书编号的方法如下：

1、访问国家职业资格证书全国联网查询系统；

2、在查询页面输入要查询人的姓名和身份证号码；

3、点击查询按钮，系统将显示相关信息。

医师资格证书的作用：

1、证明资格：医师资格证书是医生合法执业的必要条件之一，证明持有者已通过国家医师资格考试；

2、执业依据：医师资格证书是申请医师执业证书的前提，没有资格证书无法获得执业证书；

3、职业发展：医师资格证书对于医生的职称评定、职业晋升有重要影响；

4、法律责任：医师资格证书是医生在发生医疗纠纷时，证明其执业资格的法律文件；

5、教育培训：医师资格证书是医生参加进修、培训等专业学习的必备条件。

综上所述，查询医师资格证书编号可通过访问国家职业资格证书全国联网查询系统，输入待查询人的姓名和身份证号码后点击查询按钮，随即可获得所需的相关信息。

【法律依据】：

《医疗机构管理条例》

第十五条

医疗机构执业，必须进行登记，领取《医疗机构执业许可证》。

第十六条

申请医疗机构执业登记，应当具备下列条件：

（一）有设置医疗机构批准书；

（二）符合医疗机构的基本标准；

（三）有适合的名称、组织机构和场所；

（四）有与其开展的业务相适应的经费、设施、设备和专业卫生技术人员；

（五）有相应的规章制度；

（六）能够独立承担民事责任。