应用化学系主要学习化学科学的基础理论和实践技术，以及在工业、农业、医药等领域中化学原理和方法的应用。具体课程包括但不限于以下内容：

基础化学：

包括有机化学、无机化学、物理化学等基本理论知识，了解元素的性质、化合物的合成与反应机制等。

分析化学：

学习测定和分析各种物质的方法和技术，如色谱、光谱、电化学等，掌握样品的准备、分析与解释的基本原理。

物理化学：

学习物质的结构、性质与变化之间的关系，包括热力学、动力学、量子化学等方面的知识，能够理解和解释化学现象。

有机化学：

学习有机化合物的结构、合成和反应机理，了解有机物在生物、医药、化工等领域中的应用。

分子生物学：

学习生物分子的结构和功能，了解基因工程、蛋白质合成等生物技术。

应用化学：

学习化学在工业、农业、医药等领域的应用，包括化学反应的工艺条件、反应机理与产品合成等。

实验技术：

学习化学实验的基本操作技术，包括化学仪器的使用、实验安全知识等，能够进行实验设计和数据分析。

环境化学：

学习环境中化学物质的分析与监测，研究处理废水、废气等环境问题的方法和技术。

化工原理：

学习化工过程的基本原理和操作方法，包括反应工程、分离工程、传质与传热等。

专业方向课程：

部分高校按以下专业方向培养，如制药、功能材料、精细化工、药物合成、质量检测、分析与检测、药用化妆品、产品检测技术、化学生物应用、环境监测与评价等。

此外，应用化学专业的学生还需要进行大量的化学实验，熟悉化学实验的操作技能，了解不同实验方法和仪器的使用，培养实验技巧和数据处理能力。通过实习或工程实践课程，学生有机会参与真实的应用化学项目，提高实际应用能力和解决问题的能力。

综上所述，应用化学系的学习内容涵盖了化学的各个方面，并强调实际应用，旨在培养具有扎实化学基础和工程技术能力的高级专门人才。