应交增值税的审计主要包括以下几个步骤和方法：

获取或编制应交税费明细表

复核明细表中的加计数是否正确。

核对期末余额与报表数、总账数和明细分类账合计是否相符。

核对期初未交税费与税务机关认定数

检查是否存在差异，查明原因并记录。

审查纳税申报资料和相关文件

索要并审阅纳税申报资料、纳税鉴定或纳税通知以及征、免、减税的批准文件。

检查会计处理是否符合国家财税法规。

审查“应交税金——应交增值税”账户

运用审阅法、抽查法和核对法审查进项税额。

审查销项税额，确保与产品销售收入和其他业务收入相符合。

审查其他相关账户

结合长期投资、固定资产、在建工程、营业外支出、其他业务收入、营业税费及附加等科目的审计，发现未记录的应交税费。

审查存货

运用审阅法、逆查法和抽查法对存货进行审查。

审查“产品销售收入”账目

运用审阅法、盘点法、核对法对销售收入账目进行审查。

审查其他账户

结合其他账户的审查，如“在建工程”账目，确保材料、水电进项税额正确转出。

分析销售额变动率和税负率

按季计算分析销售额变动率和税负率，并与正常峰值比较，识别异常情况。

获取税务部门确认性文件

检查税务部门的收结或其他确认性文件，确保其效力，并与账面数据核对。

通过上述步骤和方法，审计人员可以全面审查应交增值税的准确性和合规性。需要注意的是，审计过程中应关注是否存在隐匿销售收入、使用非正规发票抵扣进项税额、固定资产进项税额抵扣不当等问题。