独立艺术院校的投档方式主要依据以下几个原则：

志愿优先原则 ：

艺术类招生中的顺序志愿按照“志愿优先”的原则进行投档录取。第一志愿录取结束后，若院校招生计划未完成，再对未完成招生计划的院校进行第二志愿投档录取。考生所填报的院校志愿将文化课成绩及专业成绩均符合条件的考生档案一次性全部提供给招生院校，由招生院校根据本校事先公布的录取原则进行录取。

平行志愿原则 ：

艺术类本科平行志愿投档办法是依据招生院校的录取规则，按照考生所报志愿，分别计算出考生的投档排序成绩。由计算机根据考生平行志愿的自然顺序（1-12）和对应的投档排序成绩逐一进行检索匹配。一经检索到符合投档条件且计划未满额的志愿，即进入该志愿拟投档队列；如计划已满额，但考生投档排序成绩高于该志愿拟投档队列中的考生最低分，则进入拟投档队列，同时将最低分考生从拟投档队列中移出，对被移出考生的后续志愿继续检索，直至考生全部志愿检索完毕。当符合投档要求的考生全部志愿检索完毕后，将已进入拟投档队列的考生电子档案一次性投给各院校。

综合分数原则 ：

山东省艺术类本科和高职（专科）专业均实行文化成绩与考生所填报专业成绩相关联的投档模式。关联不上专业成绩的，一律不予投档。本科批省级统考专业遵循考生志愿，关联省级统考合格成绩，根据综合分数（四舍五入保留两位小数）按招生计划1:1投档。专科批省级统考专业按类别使用综合分数（与本科同类专业折算办法相同）投档，省际联考的戏曲类专业关联考生的专业合格成绩投档。

调档比例原则 ：

对报考部分独立设置的本科艺术院校（含部分艺术类本科专业参照执行的少数高校），文化分、专业分均达到相关招生高校自行划定的录取最低控制分数线的考生，按院校提出的调档比例投档。

校考成绩原则 ：

对报考其他校考院校（部分独立设置的本科艺术院校），文化分达到省录取最低控制分数线且专业合格的考生，按院校提出的调档比例投档。

综上所述，独立艺术院校的投档方式主要遵循“志愿优先”和“平行志愿”原则，同时结合综合分数和调档比例进行录取。建议艺术生在填报志愿时，要充分了解各高校的录取规则和投档要求，合理选择志愿顺序和院校，以提高录取机会。