研究生论文查重主要是通过以下步骤和规则来计算的：

连续字符相似度判定

查重系统会检测论文中是否存在连续13个字符与已有文献相似的情况。如果发现连续13个字符相似，系统会自动判定为抄袭并标红。

分层处理与指纹创建

查重系统会对论文进行分层处理，分别按照篇章、段落、句子等层级创建指纹。然后，将这些指纹与资源库中的文献进行比对，以找出相似部分。

比对资源库

查重系统会将论文与网络上所有文献（如开放网站）以及已存储的文献（如学校购买的数据库）进行比对，并给出重复内容的百分比。

查重阈值

不同的查重系统有不同的查重阈值。例如，知网查重的阈值设定为5%，即一个段落中若有连续13个字相同，且这部分内容占整个段落的比重不超过5%，则不会被判定为抄袭。

格式与结构

论文的格式和结构也会影响查重结果。例如，同样内容的论文可能因为格式的不同而得出不同的检测结果。

引用与抄袭的区分

对于引用和抄袭，查重系统会根据设定的阈值进行判定。如果引用部分超过设定阈值，则会被判定为抄袭。

查重率计算

查重率是通过将论文中重复的字数除以总字数，再乘以100%来计算的。公式为：查重率 = （论文重复字数 / 论文总字数）* 100%。

建议

选择合适的查重系统：不同的查重系统有不同的算法和阈值，建议选择学校或导师推荐的查重系统，以确保查重结果的准确性。

注意格式和引用：在撰写论文时，注意格式正确，合理引用文献，避免连续13个字符的相似度过高。

提前查重：在提交论文前，建议提前进行查重，以便及时发现并修改重复内容，确保论文的原创性。