南开大学有6个一级学科国家重点学科,覆盖35个二级学科。这些学科包括数学、化学、光学工程、理论经济学、应用经济学和历史学等。具体的二级学科包括但不限于基础数学、计算数学、概率论与数理统计、无机化学、分析化学、有机化学、物理化学、高分子化学与物理、光学与光子学材料制备及其性能、光学与光子学器件及其物理机制、政治经济学史、经济史、世界经济、西方经济学、人口资源与环境经济学、经济思想史、区域经济学、金融学、产业经济学、国际贸易学、财政学、数量经济学、国民经济学、劳动经济学、统计学、国防经济、史学理论与史学史、考古学及博物馆学、专门史、中国古代史、中国近代史、世界史、历史地理学、历史文献学等。
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