函授档案丢失的补办流程如下：

联系函授站点

一旦发现函授大专档案丢失，应立即联系函授站点，说明情况并询问补办档案的具体流程和所需材料。根据要求，准备相关材料，如身份证、毕业证、档案遗失证明、档案补办申请表等。

准备补办材料

需要补办的主要资料包括入学登记表、学生成绩单、毕业生登记表等。这些资料都是档案内的重要材料，对于证明您的学历和经历具有重要作用。特别需要注意的是，档案遗失证明可能需要在当地报纸上发布遗失声明，并保留原件或电子版作为证明材料。

提交补办申请

回到之前参加函授学习的学校，提出档案丢失需要补回的申请。准备齐全补回办理相应的资料，弄丢的证明，个人身份证，毕业证等。在老师的指引下填写补回申请表格，等老师提交上级部门审批及审批通过。

补办并密封档案

补办出来的材料要盖上相应的公章。所有档案材料补办完成后需要携带书面说明到学校找继续教育学院档案馆的老师审核密封盖章。最后，将所有资料装入档案袋，并在档案袋外用密封条，密封加盖公章。

合并存档

补办好的函授档案不能单独存档，需要找到自己原先统招学历的档案合并之后一起托管。在就业指导中心的系统中录入个人档案信息，以便未来查询和使用。

注意事项

如果档案是由于单位保管不善丢失的，可以由单位出具书面说明加盖人事单位部门公章，然后到学校补办。如果是因为自己的原因丢失，由学生本人写出书面说明和书面补办申请书，带着这两份材料以及个人身份材料到学校办理档案补办。

通过以上步骤，您可以完成函授档案的补办流程。建议您尽早联系函授站点或毕业学校，以确保补办过程顺利并按时完成。