山东菏泽市区有以下几所大学：

菏泽学院

菏泽学院位于山东省菏泽市，是一所全日制普通本科高校。

学校前身是始建于1949年的冀鲁豫区第二师范学校，历史上曾更名为平原省立菏泽师范学校、山东省菏泽第一师范学校、菏泽师范专科学校。

2002年，菏泽师范专科学校、菏泽教育学院、菏泽广播电视大学3所学校合并，同时并入菏泽师范学校、菏泽农业学校，筹建菏泽学院。

2004年，教育部正式批准更名为菏泽学院。

学校设有21个教学单位，拥有64个本科专业，涉及文学、历史学、经济学、法学、理学、工学、农学、教育学、管理学、艺术学十大学科门类。

菏泽医学高等专科学校

菏泽医学专科学校位于中国牡丹之都——山东省菏泽市，是一所由山东省人民政府举办的省属公办全日制普通高等专科学校。

学校的前身是1950年经国务院批准建立的平原省卫生学校；1958年，更名为菏泽地区医学专科学校，后又历经山东省菏泽地区卫生学校、山东省菏泽地区医学专科学校、山东省菏泽地区卫生学校等办学时期；1978年经国务院批准，更名为菏泽医学专科学校。

菏泽家政职业学院

菏泽家政职业学院是我国第一所独立设置、以家政为特色的普通高等职业院校，坐落在鲁苏豫皖四省交界的单县开发区。

学校规划占地744亩，建筑面积15.1万平方米，总资产2.16亿元。

菏泽职业学院

菏泽职业学院是一所具有60年办学历史的公办全日制普通高等学校，由原菏泽财经学校、菏泽工业学校和菏泽农业机械化学校（职工中专）三所学校合并而成。

学校于2007年开始筹建，2012年12月经山东省人民政府批准、教育部备案正式成立。

综上所述，菏泽市区共有4所大学，分别是菏泽学院、菏泽医学专科学校、菏泽家政职业学院和菏泽职业学院。