南京自考较好的学校有以下几所：

南京农业大学：

南京农业大学是“双一流”、“211工程”重点建设学校，知名度高，考试难度较低，有平时分计入总成绩，统考少部分实践课。证书认可度高，毕业证书在升学、就业、出国留学、考公考研等方面社会认可度高。

南京大学：

南京大学是教育部直属的综合性全国重点大学，位列“双一流”世界一流大学A类建设高校、“211工程”、“985工程”，专业广泛，特别是公共关系等专业更是主考学校。

南京航空航天大学：

南京航空航天大学是江苏省内知名高校，拥有多个优势学科，是江苏省自学考试主考学校之一。

南京理工大学：

南京理工大学是“211工程”重点建设高校，在工程类学科方面具有较高声誉，也是江苏省自学考试主考学校之一。

南京财经大学：

南京财经大学以经济管理类学科为主，学科支撑配套协调发展，是江苏省属重点建设大学。

根据以上信息，如果你注重学校的知名度和考试难度，南京农业大学是一个不错的选择。如果你选择的专业在南京大学有主考权，那么南京大学也是理想的学校。南京航空航天大学、南京理工大学和南京财经大学分别在航空、理工和财经领域有优势，可以根据专业选择进行报考。

建议：

选择学校：根据你的专业兴趣和职业规划，选择有主考权的学校，同时考虑学校的知名度和考试难度。

专业选择：不同的专业主考学校不同，选择与自己专业相关的学校可以提高通过率。

了解政策：详细了解各学校的自考助学政策，包括学习形式、考试安排、证书认可度等，以便做出最适合自己的选择。