在日本的留学生接种新冠疫苗的流程如下：

收到接种券：在日本的留学生通常会收到所在自治体（区役所或市役所）发放的疫苗接种券。这是接种疫苗的第一步。

预约接种：收到接种券后，留学生需要登录所在区役所或市役所的官方网站进行预约。预约时需要输入接种券上的编号，并选择接种时间和地点。预约成功后，会收到确认邮件。

准备材料：接种当天需要携带以下材料：

在留卡

接种券

予诊票（健康问卷）此外，建议穿便于露出胳膊的衣服。

接种流程：

到达接种会场后，首先进行体温测量和消毒。

确认接种券和预约信息后，填写予诊票。

提交在留卡进行身份确认。

进入接种区，按顺序等待接种。

接种后需在原地观察15分钟，确认无异常反应后方可离开。

接种后的反应：常见的副作用包括轻微发烧、胳膊酸痛等，通常会在1-2天内消失。如果出现严重不适，应及时就医。

第二针接种：接种第一针后，医生会告知第二针的接种时间，通常间隔3-4周。

其他接种方式：如果无法通过自治体预约到疫苗，可以考虑以下方式：

预约自卫队大规模接种中心的疫苗。

如果已参加工作，可以通过公司申请职场接种。

需要注意的是，日本的疫苗接种属于自愿行为，留学生可以根据自身情况决定是否接种。

希望以上信息对在日留学生有所帮助。如果有更多问题，建议咨询所在区役所或市役所的相关部门。