日本留学选择哪个地方最好学，主要取决于个人的学术兴趣、专业目标以及生活偏好。以下是一些建议：

东京

东京大学：作为日本最高学术殿堂和七所旧帝国大学之首，东京大学在全球享有极高的声誉。其理科和工科在世界上处于领先地位，物理和化学世界排名第一，工学基本都排在3到1的位置。

早稻田大学：日本私立大学中最顶尖的大学之一，以政治经济学、文学、商学等学科著称。早稻田大学的名气较高，许多中国现代革命家如陈独秀、李大钊都是其毕业生。

庆应义塾大学：日本最古老的私立综合性高等教育机构，以经济学、医学、文学等享誉全国。庆应义塾大学通过在教育、研究、医疗领域的不懈努力，入选了2014年度文部科学省“超级国际化大学计划”。

筑波大学：位于茨城县筑波市，是一所著名的研究型综合国立大学，也是世界一流学府。筑波大学在科学研究方面表现突出，入选了日本超级国际化大学计划A类顶尖校。

京都

京都大学：与东京大学并称为日本的“清华北大”，在科学研究、文科和理科等多个领域都有卓越的成就。京都大学几乎没什么不强的专业，属于超一流大学。

同志社大学、 立命馆大学、 京都工艺纤维大学、 京都府立大学：这些大学也位于京都，各自在特定领域有显著的优势。

大阪

大阪大学：日本一所国立研究型综合大学，前身为7所旧制帝国大学之一，创建于1838年。大阪大学在医学、工学、理学等领域国际评价很高，医学院的学生是各大医院争抢的对象。

关西地区：包括京都、大阪、神户等城市，这里的大学如京都大学、大阪大学、神户大学等也都有很高的学术水平和国际声誉。

其他城市

筑波市：筑波大学所在地，是一个以科学研究为主的世界一流学府，适合对科学研究感兴趣的留学生。

仙台：东北大学所在地，医学、工学、理学闻名，鲁迅曾在此学习医学。

建议

学术兴趣：首先明确自己的学术兴趣和专业目标，选择相应领域的顶尖大学。

生活偏好：考虑自己的生活偏好，东京和京都虽然学术氛围浓厚，但生活成本较高；大阪和关西地区生活成本较低，且生活节奏相对较慢。

语言环境：选择语言学校时，可以考虑学校所在的地理位置，以便更好地融入当地生活并提高语言水平。

综合考虑以上因素，东京和京都无疑是日本留学的最佳选择，尤其是对于理工科和商科的学生。如果对历史文化有浓厚兴趣，京都也是一个非常好的选择。大阪和关西地区则适合希望生活成本较低、环境宁静的学生。