广州日本考研留学的选择可以考虑以下几所大学和机构：

东京大学：

作为日本最历史悠久和最负盛名的大学之一，东京大学在工程、生命科学和人文学科专业方面拥有优质的教育资源，是研究生优秀的选择。

京都大学：

京都大学是日本顶尖的综合性大学之一，在工程、医学、计算机科学和物理等领域具有领先的研究机构，其研究生项目在全日本享有盛誉。

大阪大学：

大阪大学在综合科学、人文科学、医学、法律及经济学等领域排名很高，并为研究生提供各种形式的研究支持。

北海道大学：

北海道大学是日本北海道地区最知名的综合性大学之一，也是日本最优秀的自然科学院校之一。

樱花国际日语：

由新世界教育集团引进的独立教育机构，提供先进的日语系统教育、全外教豪华阵容小班教学、随时随地学习的方便条件，以及新颖科学的多媒体授课和对日本文化的深入接触。

新东方前途出国：

新东方旗下从事出国留学服务的专职机构，提供“一站式”出国留学咨询服务，专业的留学顾问为各类留学申请保驾护航。

启德留学：

综合性留学机构，起初主要做美国申请，后延伸出日本留学项目，案例展示系统做得非常漂亮。

前程日本：

日本总部位于东京，国内总部位于北京，是教育部认可的具有留学中介资格的机构之一，擅长申请日本研究生、SGU和语言学校等。

这些建议综合考虑了大学的教育质量、专业优势以及留学机构的口碑和服务。建议根据自己的学术背景、研究兴趣和财务预算，选择最适合自己的学校和机构。