中国科学院在三亚的研究所是 中国科学院深海科学与工程研究所 （简称“深海所”）。
深海所成立于2011年，由中国科学院、海南省人民政府和三亚市人民政府三方联合共建。研究所坐落于海南省三亚市鹿回头半岛，致力于深海科学的探索与研究，是我国深海科学与工程研究的国家队。
深海所的主要研究方向包括深海科学研究、工程技术研发、成果转移转化、科技服务和人才培养。研究所配备了先进的深海工程技术与装备、实验平台和基础设施，结合其区位优势，开展了一系列深海科学问题研究。
深海所于2016年5月正式运行，截至2022年10月31日，研究所占地约109亩，总建筑面积50183.95平方米，拥有在职职工249人。研究所设有深海科学研究部、深海工程技术部和海洋装备与运行管理中心三个主要业务单元。
此外，深海所还承担了多项国家级科研项目，并在深海探测、深海资源开发、深海环境保护等方面取得了显著成果，为我国海洋强国建设做出了重要贡献。
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