EMS和机要快递在多个方面存在显著区别：

效率 ：

EMS ：通常提供较快的快递服务，适合寄送文件、包裹等物品，具有全球范围内的快速投递能力。

机要 ：邮寄速度相对较慢，因为采用专人押送，流程更为复杂和严格。

安全性 ：

EMS ：虽然提供快递服务，但在安全性方面相对较弱，容易受到各种因素的影响。

机要 ：采用专人押送，安全性更高，适合传递国家机密文件、重要资料等，保密性更强。

业务办理 ：

EMS ：个人和企业均可办理，流程相对简单，可以通过快递单号在网上查询物流信息。

机要 ：仅针对国企、事业单位开放，个人和民企私企无法办理，且不能公开查询物流信息。

邮寄方式 ：

EMS ：与普通快递相同，通过邮政系统进行分拣、投递和接收。

机要 ：有特殊的邮寄途径和程序，邮局有专门的安全保障措施。

收件范围 ：

EMS ：适用于寄送各种物品，包括文件、包裹、衣物、食品等。

机要 ：主要用于传递国家机密文件、重要资料和档案等，收件范围较为有限。

查询方式 ：

EMS ：可以通过快递单号在网上查询物流信息，方便快捷。

机要 ：不能公开查询物流信息，保密性极高。

单位不同 ：

EMS ：由邮政部门提供，是Express Mail Service的简称，服务于所有人。

机要 ：由党、政、军以及企事业单位的保密部门通过机要通信或专人送取。

建议 ：

如果需要寄送重要文件或资料，且对安全性有较高要求，建议选择机要快递。

如果需要快速寄送普通物品，EMS是更为便捷的选择。