四川高考本科率较低的原因是多方面的，主要包括以下几点：

考生人数众多 ：四川省的高考报名人数一直很高，近年来更是突破了80万大关，竞争非常激烈。

教育资源分布不均衡 ：四川省内的教育资源分布不均衡，一些地区学校和师资力量匮乏，家长也不重视教育，导致整体教育水平相对滞后。

高考难度较大 ：尤其是文科试卷，题目难度较高，要求考生具备较强的综合素质和应试能力。

高校招生计划有限 ：四川省的高校招生计划相对有限，不能完全满足所有考生的需求。

分省录取政策 ：中国的高考实行分省录取政策，不同省份的高考试卷和招生计划不同，导致高考分数线存在差异。

经济发展水平 ：四川省内一些地区经济发展水平相对落后，可能影响了对教育的投入和重视程度。

复读考生数量众多 ：四川的复读考生数量众多，这些考生再次参加高考，增加了整体竞争压力，从而拉低了录取率。

高考制度问题 ：一些地方的高中教育存在偏科、应试教育等问题，这也影响了学生的考试成绩。

滑档现象严重 ：由于竞争大，志愿填报不当或者分数线过高导致大量考生滑档。

社会经济因素 ：四川一些地区经济条件较差，教育资源有限，加之传统观念中“读书无用”的思想影响，导致部分学生和家长对高考的重视程度不够。

综上所述，四川高考本科率低的原因主要是考生人数众多、教育资源分布不均衡、复读考生数量多、高考制度问题、区域经济因素以及录取名额限制等多方面因素共同作用的结果。