清华大学被认为最难的专业主要包括 计算机科学与技术系 、 工程系 、 电子工程系 、 工程物理系 和 艺术与科技专业 等。以下是对这些专业的详细分析：

计算机科学与技术系 ：

竞争激烈 ：该专业近年来竞争尤为激烈，录取分数线往往超过其他系，对学生的创新能力、实践能力和科研潜力有较高要求。

招生名额少 ：每年清华计算机系的招生名额相对较少，以往通常只有11或12个，而2020年录取了14个，竞争非常激烈。

专业课难度大 ：计算机专业的专业课，尤其是912科目，难度较高，相关资料相对较少，且卷子多为回忆版，没有标准答案。

工程系 ：

高竞争性 ：包括材料科学与工程专业、电气工程及其自动化专业等，这些专业对学生的数学、物理和英语成绩要求极高，录取分数线通常在700分以上。

综合素质要求高 ：这些专业对学生的综合素质要求很高，录取分数线也相对较高。

电子工程系 ：

竞争激烈 ：特别是通信与信息系统二级学科，被认为是清华大学最难考的专业之一。

数学和物理要求高 ：该专业对学生的数学和物理成绩要求也很高，专业竞争激烈，录取分数线同样在700分以上。

工程物理系 ：

研究生录取难度大 ：包括核技术及应用、技术物理、核能科学与工程管理、安全科学与技术、医学物理与工程、近代物理等研究所，研究生录取难度很大。

艺术与科技专业 ：

艺术素养和创新能力要求高 ：对于艺考生来说，艺术与科技专业的报考难度也不容小觑，需要考生具备较高的艺术素养和创新能力。

其他专业 ：

五道口金融学院 ：金融硕士专业非常受欢迎，竞争同样激烈。

土木水利学院 ：土木工程专业被誉为清华大学的黄金专业，录取分数线极高，平均每年招收人数仅1人，竞争极为激烈。

建筑专业 ：作为清华大学的四大王牌专业之一，建筑专业的录取分数线也非常高。

经管（尤其是技术经济学和金融两个二级学科） ：金融硕士专业竞争非常激烈，报录比极低。

综上所述，清华大学最难的专业主要集中在计算机科学与技术系、工程系、电子工程系、工程物理系以及艺术与科技专业等。这些专业不仅竞争激烈，而且对学生的学术能力和综合素质要求极高。建议学生在选择专业时，充分了解各个专业的特点和要求，做好充分的准备和规划。