根据搜索结果，南京地区在动漫考研方面表现突出的院校主要有以下两所，供参考：

一、南京艺术学院

综合实力与排名

南京艺术学院是江苏省重点建设高校，也是国家文化和旅游部、江苏省人民政府共建高校，属于江苏省高水平大学“高峰计划”建设高校。在动画专业领域，该校长期位居省内综合类院校前列，考研难度适中。

录取优势

初试参考书目较少（仅2.5本），且《影视视听语言》与《艺术学基础知识》内容重合，可互补学习。

阅卷老师相对宽松，初试分数常超预期。

适合人群

适合对美术基础扎实、希望进入综合类艺术院校的学生，尤其是动画专业方向。

二、南京师范大学

综合实力与排名

南京师范大学是江苏省重点建设高校，动画专业在省内具有较高认可度，综合师资力量较强，考研难度适中。

录取特点

动画专业与文学、设计等学科交叉融合，适合跨学科背景考生。

综合类院校的考试内容更注重理论基础，适合理论功底较好的考生。

适合人群

适合文科背景、对动画理论感兴趣，或希望未来向教育、传媒领域发展的考生。

其他建议

中央美术学院/中国美术学院 ：若追求顶尖艺术院校，但需注意竞争激烈，建议结合自身基础与兴趣选择。

四川传媒学院 ：年轻且有行业认可度，适合希望进入动画行业的考生。

总结 ：南京艺术学院和南京师范大学是南京地区考研动漫专业的较优选择，前者以综合实力和录取优势见长，后者则以学科交叉和理论基础为特色。考生可根据自身情况选择，并结合多所院校的招生简章进一步确认。