根据搜索结果，重庆地区在动画专业考研方面表现突出的院校主要有以下两所，供参考：

一、综合实力较强的院校

四川美术学院

位于重庆，是西南地区动画专业实力顶尖的院校，拥有国家级动画专业建设点，教学资源丰富且行业认可度高。

建议优先考虑，尤其适合追求高学术水平和行业认可度的考生。

重庆邮电大学

动画专业为省级重点建设专业，注重理论与实践结合，培养方向涵盖动画设计与制作、数字媒体技术等。

录取难度适中，适合希望在本土发展且希望掌握扎实基础的考生。

二、其他相关院校

重庆工商大学 （动画专业B级）：在动画制作和产业应用方面有特色，适合关注行业实践经验的考生。

重庆文理学院/三峡学院/移通学院/工程学院 ：部分院校的动画专业也具备一定实力，但整体排名和资源相对较弱，可根据具体兴趣和职业规划选择。

三、报考建议

明确目标 ：若追求全国顶尖学府，北京电影学院、中国传媒大学是行业顶尖院校，但录取竞争激烈；若以本地发展为导向，四川美术学院、重庆邮电大学更合适。

结合自身 ：参考学校排名需结合所在省份的招生政策、竞争压力及个人分数情况，可通过招生简章或咨询学长学姐获取最新动态。

关注特色 ：部分院校（如重庆邮电大学）在动画与新媒体结合方面有优势，可优先考虑相关方向。

建议考生结合自身分数、职业规划及对学术或行业需求的偏好，综合评估后选择院校。