民办高校学生考研难度较大的原因主要有以下几点：

教育资源相对较少 ：民办学校在考研辅导方面的资源相对较少，如师资力量、教学设施等，这可能会使考生在备考过程中面临更多困难，需要自己更加努力去获取信息和资源。

学习氛围和习惯可能存在差异 ：民办学校的学习氛围和习惯可能与公办学校有所不同，有些学生可能缺乏自律能力和良好的学习习惯，这可能会影响考研的备考效果。

经济压力 ：民办学校的学费相对较高，对于一些家庭经济条件不太好的考生来说，可能会面临经济压力，使得考研备考过程更加困难。

考研录取率相对较低 ：由于民办学校的整体实力和知名度相对较低，一些研究生招生单位可能会对民办学校的考生有所限制，使得民办学校的考生在录取时面临更大的竞争压力。

保研率不同 ：三本高校的保研率相对较低，而985和211高校的保研率较高，这使得三本学生在考研时需要付出更多的努力，才能获得录取机会。

学习基础薄弱 ：民办高校的学生普遍存在学习基础较差的问题，这主要是由于他们在高考中的表现不如其他学生，导致进入民办高校学习。

学术资源和科研平台不足 ：民办大学在学术资源和科研平台方面通常不如985和211高校，这使得学生在科研能力方面较为薄弱，不利于考研。

面试竞争激烈 ：在考研的面试环节，民办高校的学生往往需要更加努力地脱颖而出，以获得导师的青睐。

就业压力 ：民办高校的学生面临较大的就业压力，这使得他们更倾向于通过考研来提升自己的学历和竞争力。

考研门槛和歧视 ：部分985和211高校在招收研究生时对考生的本科教育经历有门槛，对民办大学或一般二本的学生存在一定程度的排斥。

综上所述，民办高校学生考研难度较大的原因是多方面的，包括教育资源不足、学习氛围和习惯的差异、经济压力、录取率低、保研率低、学习基础薄弱、学术资源和科研平台不足、面试竞争激烈、就业压力以及考研门槛和歧视等。因此，民办高校的学生在准备考研时需要付出更多的努力和时间，以应对这些挑战。