当遇到异常普通发票时，企业应按照以下步骤进行处理：

核实发票信息 ：

确认发票代码、号码、金额等信息是否正确。

联系开票方 ：

如果发现发票信息错误，如金额、税号等，联系开票方进行更正。若发票已使用，根据具体情况可能需要退回或更换。

保存证据 ：

在整个处理过程中，保留相关沟通记录和凭证，以备后续审计或查询。

补缴税款和罚款 ：

若业务不真实但未造成偷逃骗税后果，按发票管理办法处罚。若造成偷逃骗税后果，需按照税收征管法处罚，严重者移送司法机关。

增值税处理 ：

尚未申报抵扣的，暂不允许抵扣。已经申报抵扣的，作进项税额转出处理。已申报出口退税但尚未办理的，暂不允许办理出口退税。适用增值税免抵退税办法的纳税人，需根据异常凭证上注明的增值税额作进项税额转出处理。

消费税处理 ：

尚未申报扣除原料已纳消费税税款的，暂不允许抵扣。已经申报抵扣的，冲减当期允许抵扣的消费税税款，不足冲减的应当补缴税款。

纳税信用A级纳税人处理 ：

可以在接到税务机关通知之日起10个工作日内，向主管税务机关提出核实申请。

与税务机关沟通 ：

及时与税务人员取得联系，了解清楚发票情况，并配合处理。

专业咨询 ：

如遇特殊情况或无法自行解决，可咨询专业税务人员或机构协助处理。

提出核查申请 ：

如果对税务机关认定的异常凭证存有异议，应当自收到通知之日起20个工作日内，向主管税务机关提出核查申请，并提交业务合同、银行凭证、运输仓储证明等有关说明材料。

证明“四流一致” ：

如果企业能证明合同、货物、发票、资金等“四流一致”，则可解除异常凭证的认定，相关发票可以正常抵扣或者扣除。

通过以上步骤，企业可以有效地处理异常普通发票，确保税务合规并维护自身权益。