南昌和济宁两个城市各有其优势，具体哪个更好需要根据个人的需求和偏好来决定。以下是一些对比分析：

大学排名 ：

南昌大学 ：根据2022年软科中国大学排行榜，南昌大学在全国排名第75名，较2021年提高了3名，显示出其综合实力和名气的提升。

济宁学院 ：济宁学院在全国排名第481名，较2021年提高了29名，虽然排名较低，但也在逐年上升。

历史底蕴 ：

南昌医学院 ：创办于2001年，历史相对较短，底蕴不如济宁医学院。

济宁医学院 ：创办于1952年，拥有较为深厚的历史底蕴。

专业优势 ：

南昌医学院 ：王牌专业是中医学，学制为5年（本科）。

济宁医学院 ：王牌专业是临床医学，也是国家特色专业，学制同样为5年（本科）。

录取分数 ：

南昌医学院 ：以天津理科2023年录取分数为例，中医学专业最低分为549分。

济宁医学院 ：以天津理科2023年录取分数为例，临床医学专业最低分为576分，高于南昌医学院。

建议

如果重视大学排名和综合实力 ，南昌大学无疑是更好的选择。

如果看重历史底蕴和专业特色 ，且对中医学或临床医学有浓厚兴趣，济宁医学院也是一个值得考虑的选项。

如果考虑地理位置和未来发展潜力 ，南昌作为江西省会，经济发展较快，可能有更多的发展机会。而济宁作为山东省的重要城市，也有其独特的地理优势和产业基础。

综合以上信息，南昌大学在整体实力和名气上优于济宁学院，但济宁医学院在专业特色和历史底蕴上有其独特优势。选择哪个城市更好，还需根据个人的职业规划和兴趣爱好来决定。