修改会计电算化系统通常涉及以下步骤：

系统管理

以系统管理员身份登录系统管理模块。

执行“系统（S）”->“注册”，输入服务器信息（默认）和操作员信息（如admin，口令为空），然后单击确定。

设置操作员权限

在“权限”->“操作员”工具栏中，增加新的操作员，输入编号、姓名、口令、确认口令、所属部门等信息。

建立或修改账套

执行“帐套”->“建立”或选择已有的账套进行“修改”。

输入账套信息，包括帐套号、帐套名称、启用会计期等。

进行单位信息设置，如单位名称、核算类型、本币代码等。

设置基础信息，如分类编码方案等。

确认并保存所有修改。

调整账务组织程序和报表公式

根据需要调整账务组织程序，例如日常业务、编制损益表、总账结转损益到本年利润等业务的处理顺序。

修改损益表中的“所得税”项目公式，由于所得税的计算过程滞后于损益表的编制，因此需要单独设置。

跨年度账项调整

可以选择将系统生成的报表导出，再用Excel直接对报表项目进行调整，并在工作底稿中加以说明。

或者，在上年年末未进行年结之前备份一套账套文件，再将原账套进行年结后用于下年的日常会计业务处理，并在备份账套内录入全部调整凭证。

另外，也可以将资产负债表日后事项的调整凭证录入下年使用的账套内，同时修改系统自动生成报表的计算公式，以原有报表取数公式加上手工计算的调整数。

保存修改

在进行所有必要的调整后，确保保存所有修改，以便系统能够正确运行并反映最新的会计信息。

建议在修改会计电算化系统时，详细记录每一步的操作，并备份相关数据，以防出现意外情况。同时，确保所有修改符合会计制度和公司的内部流程。