工程会计需要缴纳的税种及缴税程序如下：

增值税

税率：通常为3%。

计算：基于工程项目的收入计算。

缴税程序：包括进项税额的认证、销项税的抄税、网上申报等步骤。

城市维护建设税

税率：根据纳税人所在地的不同，税率可能为7%、5%或1%。

计算：基于增值税的一定比例计算。

教育费附加

税率：通常为3%。

计算：基于增值税的一定比例计算。

地方教育费附加

税率：通常为2%。

计算：基于增值税的一定比例计算。

印花税

税率：通常按照建筑安装工程承包合同金额的0.3%计算缴纳。

计算：基于合同金额。

个人所得税

税率：可能根据所得类型（如综合所得、经营所得等）和金额的不同而变化，通常在1%至45%之间。

计算：基于工程款项支付的个人收入计算。

企业所得税

税率：通常为25%，对于小微企业可能有税收优惠。

计算：根据企业利润计算。

收入确认：建筑企业应按照完工百分比法确认收入。

其他可能的税费

水利基金：具体比例依据地方规定而定。

房产税：根据房产原值或租金收入计算。

土地使用税：根据实际占用土地面积计算。

资源税、土地增值税、契税：可能包括的其他税种。

缴税程序

进项税额的认证：

每月或每季度进行进项税额的认证，以确保可以抵扣销项税额。

销项税的抄税：

每月或每季度进行销项税的抄税，以确保正确计算应缴纳的增值税额。

网上申报：

通过电子税务局进行增值税、城建税、教育费附加、地方教育费附加、印花税、个人所得税和企业所得税的网上申报。

提交财务报表：

定期提交财务报表，以便税务机关审核。

缴纳税款：

在规定的期限内通过银行或税务机关指定的方式缴纳各项税款。

建议：

及时申报：确保按时进行各项税种的申报和缴纳，避免滞纳金和罚款。

咨询专业人士：如有复杂的税务问题，建议咨询专业的税务顾问或会计师，以确保合规和优化税务负担。