公司年报审计可以按照以下步骤进行：

审计准备阶段

了解被审计单位基本情况：查阅上一年度审计报告，了解被审计单位的行业特点、业务范围、组织结构、财务状况、内部控制制度等。与被审计单位管理层沟通，明确审计目的、范围和时间安排。

签订审计业务约定书：明确双方的权利和义务，包括审计范围、审计费用、报告提交时间等。

组建审计项目组：根据被审计单位的规模和复杂程度，选派具有专业胜任能力的注册会计师和审计人员组成项目组。确定项目负责人，明确项目组成员的分工。

制定审计计划：根据被审计单位的情况和审计目标，制定总体审计策略和具体审计计划。确定重要性水平、审计风险评估、审计程序和时间安排等。

审计实施阶段

内部控制测试：了解被审计单位的内部控制制度，进行控制测试，评估内部控制的有效性。如果内部控制存在缺陷，可能需要调整审计策略和扩大实质性测试的范围。

实质性测试：对财务报表项目进行实质性测试，包括账户余额测试、交易和事项测试、分析性程序等。收集审计证据，包括会计凭证、账簿、报表、合同、银行对账单等。对重大交易和事项进行重点审计，如关联方交易、资产减值、收入确认等。

审计抽样：根据审计目标和重要性水平，采用适当的审计抽样方法，选取样本进行测试。对样本结果进行评价，推断总体的特征。

审计工作底稿编制：及时记录审计过程和结果，编制审计工作底稿。工作底稿应内容完整、格式规范、记录清晰、结论明确。

审计完成阶段