非盈利机构需要缴纳的税种主要包括以下几种：

企业所得税

非盈利组织需要缴纳企业所得税，但可以享受一定的优惠政策。只有经过免税资格认定的非营利组织，其特定收入才可免征企业所得税。

个人所得税

针对非营利组织的主要决策者的个人收入征收。

联邦其他所得税

根据非盈利机构所获得的利润征收。

营业税

按照该国或州税法制定的标准为非盈利机构征收，通常可能涉及到销售、服务活动和其他活动。

增值税

在提供服务或销售商品时可能需要缴纳。

城市维护建设税

如果缴纳了增值税、营业税和消费税，则需按一定比例缴纳。

房产税

如果拥有自用房产，可能需要缴纳。

城镇土地使用税

在城市、县城、建制镇和工矿区的土地产权人需要缴税。

印花税

在签订某些合同或进行某些交易时可能需要缴纳。

遗产税和赠与税

接受捐赠或遗产时可能需要缴纳。

联邦资本利得税

对非盈利机构获得的任何资本利得和投资收益征收。

特许税

联邦和州的特许税，用以补偿非盈利机构提供的服务。

建议

非盈利机构在运营过程中需要了解并遵守相关的税法规定，确保合法合规地进行税务申报和缴纳。同时，非营利组织应积极申请免税资格认定，以最大限度地享受税收优惠政策。建议非盈利机构咨询专业的税务顾问，以确保税务处理的准确性和合规性。