三本学校收费高的原因主要包括以下几点：

民办性质 ：三本大学多为民办学校或大学的独立院校，没有国家财政的直接支持，需要自负盈亏。由于缺乏国家财政拨款，这些学校的运营资金主要依赖于学生缴纳的学费。

缺乏资金支持 ：与公办的一二本大学相比，三本大学不会从政府获得设施设备补贴，因此需要自行负担包括教师工资、教学设施等在内的各项费用，而这些费用通常需要通过提高学费来回收。

盈利性质 ：民办学校本质上属于盈利性机构，需要合理赚取利润以维持运营和发展。因此，学费较高也是其盈利的一种方式。

自我承担成本 ：三本院校需要自行负担所有运营成本，包括教师工资、教学设施等，而这些成本通常需要通过提高学费来回收。

地区和专业差异 ：不同地区的三本院校以及不同专业的学费也会有所差异，一些特殊专业如艺术类专业可能收费更高。

教育质量和资源投入 ：为了提供良好的教学和研究环境，三本大学需要投入较多的教育资源，包括实验室设备、图书资料、教师培训等方面的费用。这些投入会增加学校的运营成本，从而导致学费相对较高。

市场需求和竞争压力 ：随着高等教育市场的竞争日益激烈，三本大学需要不断提升教学质量和学生就业竞争力，为此需要投入更多的资源和资金，这也是导致学费偏高的一个原因。

财务独立 ：三本大学的财务独立性较高，它们需要从学生那里收取足够的学费来维持运营和发展。

地理位置 ：一些三本大学位于发达城市或地段，这些地区的办学成本更高，因此学费也相应更贵。

综上所述，三本学校收费高的主要原因是其民办性质、缺乏国家财政支持、需要自负盈亏、盈利性质以及较高的教育质量和资源投入等因素。建议学生在选择学校时，可以综合考虑自身经济情况和职业规划，选择最适合自己的学校。