自考科目停考后，考生有以下几种处理方式：

在停考过渡期内完成考试

如果考生仍在停考过渡期内，应尽快完成所有科目的考试。一旦通过所有科目，仍然可以申请该专业毕业。

过渡期一般为2至3年，具体时间由各省教育招生考试院规定。

转考其他专业

如果考生无法在停考过渡期内完成所有考试，可以选择转考到其他相似的专业。已经考试合格的课程和学分在新的专业中可能仍然有效，具体要看新专业的课程设置和考试要求。

转考时，考生应尽量选择与原专业相近或相关的专业，以便更好地利用已有的学习成果。

转考到其他省份

如果考生仍想以当前的专业申请毕业，也可以考虑将考籍转出到有相应专业的其他省市继续学习。但需注意，已合格的课程和学分是否有效，需根据转入省份的专业考试计划来确定。

了解并咨询相关政策

面对专业停考，考生应及时了解停考原因和过渡期安排，并向当地自考办咨询相关政策，以便作出最合适的决策。

建议

尽早规划：一旦发现专业被停考，考生应尽早制定学习计划，合理安排时间，争取在过渡期内完成所有科目。

选择相近专业：转考时，选择与原专业相近或相关的专业，以便更好地利用已有的学习成果。

关注政策变化：及时关注停考专业的过渡期安排和相关政策，以便及时作出调整。

通过以上方法，考生可以尽量减少因专业停考而带来的影响，并顺利完成自学考试。