学校的审计工作可以由以下几种机构进行：

外部独立审计公司或专业机构

通常由会计师事务所或审计公司的审计师担任，负责学校的财务、会计、管理制度等进行审计，确保学校的财务活动符合相关法律法规和规定，并提供独立的审计意见和建议。

内部审计机构

学校可以设立独立的内部审计机构，即审计处，代表学校对校内各项经济管理活动进行审计监督、评价、咨询与服务。审计处在学校党委、校长的直接领导下，依据国家法律、法规和政策，以及上级主管部门、学校的规章制度，独立行使学校内部审计的职权，对学校负责并向党委、校长报告工作，同时接受上级审计机关的业务指导和监督。

审计局

审计局主要负责政府机构、行政事业单位、国有企业以及国有控股公司的财务账目进行审计。对于公立学校，审计局会负责教育资金的审计，但在实际中很少直接对某个学校进行专门的审计，更多的是在对教育局的审计或某项教育资金审计过程中抽查审计部分学校。

会计师事务所

对于私立学校，通常需要聘请会计师事务所进行审计。

建议

公立学校：可以考虑聘请外部独立审计公司或专业机构进行审计，或者设立内部审计机构进行日常审计工作，并接受审计局的抽查审计。

私立学校：建议聘请专业的会计师事务所进行审计，以确保审计的独立性和专业性。

中小学：除了接受上级主管部门的审计外，还可以考虑引入第三方审计机构进行独立审计，以提高审计的客观性和公正性。