要匿名查重本科论文，你可以采取以下几种方法：

使用免费的在线查重工具

有些免费的在线查重工具，如Turnitin、Grammarly等，允许你上传论文并自动检测其与互联网上其他文献的相似性。这些工具通常提供基本的查重功能，但可能不如付费工具准确和全面。

使用付费的专业查重工具

付费的专业查重工具，如知网查重、万方查重等，通常提供更精准和全面的查重服务。这些工具需要支付一定的费用，但它们的结果通常更为可靠。

利用学校提供的查重系统

许多高校都有自己开发的论文查重系统，这些系统通常对学生免费开放。你可以根据学校的要求，使用学校提供的查重系统进行论文查重。

注意查重工具的隐私保护

在使用任何查重工具时，确保它们有严格的隐私保护措施。一些工具可能会要求你上传论文的副本，而不是直接上传到互联网上。确保选择那些能够保护你论文隐私的工具。

多次查重并比较结果

为了确保查重的准确性，你可以多次使用不同的查重工具进行检测，并比较它们的结果。这样可以更全面地了解论文的重复情况，并找出可能遗漏的重复内容。

修改重复内容

根据查重结果，对论文中重复的内容进行修改，确保论文的原创性和独特性。修改可以包括重写句子、改变措辞、调整句子结构等。

通过以上方法，你可以在不暴露个人身份的情况下，对本科论文进行匿名查重，确保论文的原创性和学术诚信。